Стартап Chai Discovery представил ИИ для проектирования
антител
Chai-2 - это мультимодальная генеративная модель для
проектирования белков, в первую очередь антител.Модель получает на
вход только цель (антиген)
и нужный
эпитоп и с нулягенерирует все
области, определяющие комплементарность.
Для эксперимента были выбраны 52 антигена без известных антител.
Было сгенерировано по 20 разных дизайнов антитела на каждый
антиген. В итоге экспериментальная проверка показала, что половина
из 52 антигенов была успешно поражена хотя бы одним антителом.
Хит-рейт составил 16% - т. е. 16 процентов всех антител связались с
мишенями.
Современные традиционные методы, в том числе с использованием
ИИ, показывают хит-рейт на уровне 0,1%. Вживую создаются гигантские
библиотеки антител, из которых в несколько этапов выбираются
лучшие. Все это может длиться около полугода и уже только этот
этап, даже без доклинических исследований, обходится в миллионы
долларов.
С новым подходом весь процесс занял две недели, включая
экспериментальную проверку. На проектирование всех 998 антител у
Chai-2 ушло всего два часа.
С проектированием минипротеинов модель справляется еще лучше,
хит-рейт - 68%.
https://chaiassets.com/chai-2/paper/technical_report.pdf
https://x.com/chaidiscovery/status/1939684680447746050
